El protagonista principal es Ryu Hayabusa, un joven ninja que lucha contra el maléfico Jaquio / Garuda que quiere conquistar el mundo con sus esbirros y cyber monsters

?Ninja Gaiden? se basa en la versión que tuvo Game Boy from Nintendo -lanzada en diciembre del año 1991-, a la que se denominó ?Ninja Gaiden Shadow?. En esta ocasión tendremos cinco niveles, donde habrá que luchar a brazo partido para salvar a la ciudad de Nueva York. Los ataques ninja por medio del personaje principal y los enemigos estarán a la orden del día, por lo que esta conversión promete grandes dosis de acción.